Fanny Pagès

o Élaboration du projet de thèse : 
       Établissement des collaborations internationales (Belgique flamande, Venezuela, Angleterre), 
       Détermination des objectifs et problématiques de recherche, 
       Élaboration et respect du calendrier du projet, 
       Gestion du financement

         Veille scientifique
o Recueillir les données nécessaires au projet : 
       Collecte des échantillons dans les collections du MNHN
       Réalisation de scanners en 3 dimensions dans les plateformes collaboratrices
o Analyse des données obtenues pour répondre aux problématiques : 
       Réalisation d’analyses de données 3D sur différents logiciels (segmentation, reconstruction), 
       Codage d’analyses avec le langage R pour la comparaison de morphologies, 
       Codage de protocoles de machine learning (Knn) en R

o Interprétation des résultats et discussion par rapport à la littérature

o Etablissement et présentation en anglais de synthèse des résultats du projet en congrès scientifiques internationaux
o Rédaction en anglais et publication des résultats du projet dans des revues scientifiques internationales référencées avec révision par les pairs
o Gestion du financement alloué au projet
o Management de stagiaire sur de la segmentation 3D (niveau licence 1 pour une durée de 6 mois)

Thèse de doctorat en biologie

2016-2019

Anatomie comparée et fonctionnelle de l'hoazin (Opisthocomus hoazin)

Encadrée par Anick Abourachid et Anne-Claire Fabre

UMR 7179 MECADEV équipe FUNEVOL dirigée par Anthony Herrel

Muséum National d'Histoire Naturelle

Paris

Diplôme de Recherche Universitaire

2015-2016

Etude de l’asymétrie fluctuante chez le xénope (Xenopus laevis) en réponse à une contamination organique : cas de l’herbicide S-Métolachlore et ses dérivés

Encadré par Florence Mouchet

UMR 5245 EcoLab ENSAT

Institut National Polytechnique de Toulouse

Toulouse

o Élaboration du sujet de recherche en collaboration avec l'équipe encadrante :

         Définition des problématiques en adéquation avec la durée du stage

         Définition du calendrier des expérimentations

         Définition des taches annexes au projet au sein de l'équipe

         Vérification de l'éthique en vigueur sur l'expérimentation prévue

o Mise à jour sur la littérature disponible, veille scientifique régulière

o Mise en place et réalisation des expérimentations nécessaires au recueil des données post exposition

o Prise de mesures linéaires en respectant le protocole publié

o Analyse des données avec le langage R

o Interprétation des résultats et discussion par rapport à la littérature

o Rédaction d'un rapport en français et présentation des résultats de l'étude devant un jury

o Aide aux membres de l'équipe sur leurs projets, participation à diverses expérimentations, participation à la gestion de l'animalerie

o Élaboration du sujet de recherche en collaboration avec l'équipe encadrante :

         Définition des problématiques en adéquation avec la durée du stage et le thème des enseignements

         Définition du calendrier des échéances

         Mise en place d'une collaboration avec le MRI de Montpellier

o Mise à jour sur la littérature disponible, veille scientifique régulière

o Recherche et obtention d'échantillons nécessaires à la réalisation de l'étude

o Organisation d'une mission dans l'équipe en collaboration :

         Mise en conformité administrative avec les équipes concernées

         Réalisation sur place d'une formation à l'utilisation en autonomie des scanners 3D

         Réalisation de scanners 3D sur les échantillons

o Reconstruction et segmentation des modèles 3D obtenus

o Prise de mesures linéaires et volumiques en respectant le protocole publié

o Réalisation d'arbres phylogénétiques grâce aux séquences disponibles en ligne

o Analyse des données avec le langage R

o Interprétation des résultats et discussion par rapport à la littérature

o Rédaction d'un rapport en anglais et présentation de l'étude devant un jury

o Participation à l'encadrement de 8 stagiaires (niveau licence 1 à master 1 pour une durée allant de 1 à 6 mois)

Master 2 Anthropobiologie et Génétique des Populations Humaines

2014-2015

Etude de la relation morphologie-phylogénie : cas des oreilles internes des urodèles par imagerie 3D et signal phylogénétique.

Encadré par Alexandre Ribéron, Sylvain Mastrorillo et José Braga

UMRs 5174 EDB, 5245 EcoLab et 5288 AMIS

Université Paul Sabatier Toulouse 3

Toulouse

o Définition des problématiques de recherche en accord avec le sujet proposé

o Mise en place du calendrier avec l'équipe encadrante

o Recherche bibliographique, veille scientifique

o Réalisation des mesures linéaires en suivant le protocole publié

o Analyse des données avec le langage R

o Interprétation des résultats

o Rédaction d'un rapport en français et présentation du stage devant un jury

Master 1 Ecologie

2013-2014

La consanguinité influence-t-elle le niveau d’asymétrie fluctuante chez le triton marbré (Triturus marmoratus) ?
Encadré par Alexandre Ribéron et Sylvain Mastrorillo

UMRs 51174 EDB et 5245 EcoLab

Université Paul Sabatier Toulouse 3

Toulouse

Licence en Biologie des Organismes, des Populations et des Ecosystèmes, parcours biologie animale

2010-2013

Université Paul Sabatier Toulouse 3

Toulouse